L'analisi dell'allineamento della sequenza ha mostrato che il sito di mutazione della variante SARS-CoV-2 osservata nel Regno Unito, in Sudafrica e in India non si trova attualmente nella regione di progettazione del primer e della sonda.
Il kit PCR multiplex in tempo reale di Coronavirus (SARS-CoV-2) di Strongstep® (rilevamento per tre geni) può coprire e rilevare ceppi mutanti (mostrati nella tabella seguente) senza influenzare le prestazioni al momento. Perché non vi è alcun cambiamento nella regione della sequenza di rilevamento.